La faune piscicole est particulièrement sensible aux variations de l’environnement mésologiques et physiques des milieux aquatiques et ce sont bien souvent les salmonidés qui se révèlent les plus illustrateurs des perturbations des rivières. Parmi eux, l’ombre commun (Thymallus thymallus) est considéré comme une espèce particulièrement sensible, bien plus que la truite fario (Persat & Eppe, 1997) et peut être utilisé comme « guide » d’aménagement ou de gestion des milieux (Dufour, 2011). Dans le département du Haut-Rhin, cette espèce a subi une importante régression lors des années 2000 à la suite d’épisodes fréquents de pollutions et de sécheresse. A ce titre, la Fédération du Haut-Rhin pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique (FDAAPPMA68) s’est engagée dans un programme pluriannuel sur l’ensemble du département de suivi et de réhabilitation de cette espèce. Cette étude s’inscrit dans une diagnose piscicole continue dans le temps avec, comme principal indicateur de la qualité des milieux, l’ombre commun. Le présent rapport représente la dernière année de cette étude.