Ce document porte sur le diagnostic écologique des cours d'eau. Il correspond aux deux premières phases d'étude : la caractérisation globale de la qualité physique des cours d'eau et les relevés complémentaires des macro-invertébrés et de la faune piscicole. A partir des ces éléments, il sera possible de définir quels sont les principaux facteurs pénalisant les potentialités écologiques à l'échelle du site et de préciser leur impact sur les communautés biologiques.

L’IQE (Indice*de qualité écologique) a été développé par le Muséum national d’Histoire naturelle pour caractériser la biodiversité* à l’échelle d’un site d’étude d’une superficie de 10 à 100 ha. Ces inventaires cherchent à caractériser : -la patrimonialité du site : observe-t-on des espèces ou des habitats, rares, menacés ? -la fonctionnalité du site : s’inscrit-il de manière cohérente dans le paysage, peut-il participer au déplacement des espèces ? -la diversité des oiseaux et des habitats naturels. Les résultats sont restitués sous la forme d’un rapport d’expertise, qui contient :
-les résultats détaillés des inventaires ; -des représentations graphiques de ces résultats, notamment sous la forme d’un radar synthétique ; -des préconisations d’aménagement et de gestion pour conserver et favoriser la biodiversité - L’IPE (Indice de potentialité écologique) est une version succincte de l’IQE. Basé sur les mêmes critères* que l’IQE, il permet, suite à une seule journée d’inventaire, de dresser à grands traits un un pré-diagnostic d’un site.