C’est dans ce contexte que cette étude, portant sur « la réhabilitation de l’Ombre commun (Thymallus thymallus) sur la Thur », doit s’inscrire dans une diagnose piscicole continue dans le temps car les poissons sont d’excellents indicateurs de la qualité des milieux. Situé sur l’ensemble des pôles de la chaine alimentaire et présentant des exigences écologiques nuancées, ils sont particulièrement sensibles aux variations de l’environnement mésologique et physique. Parmi les espèces salmonicoles,
l’ombre commun est considéré comme une espèce particulièrement sensible et doit être utilisée comme « guide » d’aménagement ou de gestion des milieux électifs (DUFOUR, 2011). De plus, l’espèce est soumise, plus que la truite, aux aménagements des cours d’eau et aux pollutions (PERSAT & EPPE,
1997).

Dans un premier temps, la démarche du Plan Départemental pour la Protection du
milieu aquatique et la Gestion des ressources piscicoles du Haut-Rhin (PDPG) s’inscrit dans
l’objectif d’obtenir un outil permettant de définir une gestion piscicole par bassin versant à
l’échelle départementale. Dans un second temps, ce document est établi pour respecter la
réglementation établie comme suit selon l’article L.433-3 du Code de l’Environnement :
« L’exercice d’un droit de pêche emporte obligation de gestion des ressources piscicoles.
Celle-ci comporte l’établissement d’un plan de gestion. En cas de non-respect de cette
obligation, les mesures nécessaires peuvent être prises d’office par l’administration aux frais
de la personne physique ou morale qui exerce le droit de pêche ».

Les 19 et 20 avril 2011, à Paris, plus de 200 scientifiques et gestionnaires des milieux aquatiques se sont réunis lors des journées " DCE * et bioindication" du séminaire "Méthodes d'évaluation de l'état des eaux ? Situation et perspectives dans le contexte de la directive cadre sur l'eau" .
Cet ouvrage constitue une synthèse des contributions scientifiques apportées lors de ces rencontres organisées par l'Onema (Office national de l'eau et des milieux aquatiques) ainsi que des discussions qui en ont découlé durant l'année 2012 au sein du groupe de travail DCE - Eaux de surface continentales (DCE-ESC). Il concerne les bioindicateurs, des outils permettant de juger l'état écologique des masses d'eau.

Dans le cadre d’un programme de restauration et de valorisation des berges par des techniques végétales issues du génie écologique, une annexe hydraulique a été créée le long du canal de Colmar, à Horbourg-Wihr.
L’idée était de réaliser dans ce nouveau chenal uneceinture végétale semi-aquatique qui, en plus de protéger la berge, aurait le rôle de zone de fraie pour plusieurs poissons, dont le brochet.
Ce projet avait divers objectifs : zone de reproduction mais également de nourrissage et de refuge. Ce secteur aménagé pourra profiter, en plus de la faune piscicole, aux macro-invertébrés, aux oiseaux, aux amphibiens...Ce gain notable pour la faune alentours en fait également un site attractif pour les usagers
du canal et contribue à la valorisation paysagère.
Les travaux ont consisté à la création de l’annexe hydraulique, soit un chenal de 180 m de longueur et de 4 à 6 m de largeur, avec une profondeur variant de 0.20 à 1 m. Les berges sont en pente douce et végétalisées par des plantes semi-aquatiques.